自1994年机构分设以来，区局经过3次机构改革，按照经济区划和征管功能，对各机构进行了调、撤、并，目前，区局设置了办公室、人事教育科、流转税管理科、所得税管理科、征收管理科、财务管理科、监察室、机关党办、机关服务中心、信息中心、稽查局、计划征收税务科和4个管理税务所。

  机构名称                         驻地及地址                                  电话号码
1、办公室       东西湖区田园大道188号607室                   83895092

2、政策法规科   东西湖区田园大道188号508室               83228146

3、流转税管理科 东西湖区田园大道188号211室             83891576

4、所得税管理科 东西湖区田园大道188号502室             83121309

5、征收管理科   东西湖区田园大道188号506室               83891682

6、计划征收科（办税服务厅） 东西湖区田园大道188号 83219485

7、财务管理科    东西湖区田园大道188号706室                  83892021

8、人事教育科    东西湖区田园大道188号710室                 83211311

9、监察室        东西湖区田园大道188号708室                     83211310

10、机关党办     东西湖区田园大道188号806室                 83893596

11、稽查局       东西湖区田园大道188号412室                   83210036

12、信息中心     东西湖区田园大道188号601室                 83224489

13、机关服务中心 东西湖区田园大道188号705室              83228797

14、吴家山税务所 东西湖区田园大道188号201室（管辖地区：吴家山农场、慈惠农场、舵落口大市场）83891072

15、海口税务所   吴家山台商投资区海口工业园内（管辖地区：吴家山地区、鑫桥产业园、三店农场、海口工业园、高桥开发区、牧牛港、农科所、汽车交易市场）83258930

16、金银湖税务所  养殖农场将军路（管辖地区：金银湖地区、金银湖生态园柏泉农场、径河农场、养殖农场、常青花园地区）83942570

17、燕岭税务所 107国道燕岭段（管辖地区：新沟农场、新沟镇、东山农场、辛安渡农场、燕岭地区、走马岭农场、荷包湖农场 ）83092346